Philip đã thừa hưởng một đế chế khổng lồ từ cha mình, trải khắp thế giới đã biết, nhưng nhiều thách thức khó khăn nhất của ông khi làm vua sẽ xuất phát từ những vấn đề trong nước ở chính Tây Ban Nha. Tây Ban Nha vào đầu thế kỷ 17 là một tập hợp của cải - các vương quốc Castile, Aragon, Valencia và Bồ Đào Nha, các tỉnh tự trị của Catalonia và Andalusia, hoàn chỉnh với các tỉnh rộng lớn hơn của Napoli, Hà Lan, Milan, v.v. thông qua thể chế của chế độ quân chủ Castile và người của Philip IV[9]. Mỗi phần có thuế, đặc quyền và sắp xếp quân sự khác nhau; Trên thực tế, mức thuế ở nhiều tỉnh ngoại vi ít hơn ở Castile, nhưng vị trí đặc quyền của giới quý tộc Castilian ở tất cả các cấp cao của hoàng gia là một vấn đề gây tranh cãi cho các tỉnh ít được ưa chuộng. Hệ thống lỏng lẻo này đã chống lại cải cách và đánh thuế cao hơn trước đó, trớ trêu thay, Tây Ban Nha đã có lịch sử, cho đến những năm 1640 ít nhất, ít hơn số lượng các cuộc nổi dậy tài chính thông thường cho một quốc gia châu Âu hiện đại ban đầu..[10]

Trong những năm đầu tiên trị vì, chịu ảnh hưởng nặng nề từ Olivares yêu thích của hoàng gia, Philip đã tập trung vào nỗ lực cải cách các khía cạnh hỗn loạn nhất của hệ thống này. Thất vọng vì sự chậm chạp khét tiếng của hệ thống các hội đồng hoàng gia, Philip ủng hộ việc thành lập chính quyền của Olivares - các ủy ban nhỏ được thiết kế để phá vỡ hệ thống chính thức hơn và ban hành các chính sách nhanh chóng. Mặc dù thành công, những chính quyền này đã loại trừ nhiều ông lớn truyền thống và gây ra sự phẫn nộ. Olivares đưa ra ý tưởng về Unión de Armas, hay 'Liên minh vũ khí'. Điều này sẽ liên quan đến việc thành lập một lực lượng gồm 140.000 binh sĩ được trả lương, được hỗ trợ bởi các khoản thuế công bằng từ khắp Đế quốc, và được gọi là "đề xuất tầm nhìn xa nhất của bất kỳ chính khách nào trong thời đại"; trong thực tế, tuy nhiên, nó đã gặp phải sự phản đối quyết liệt từ các hội đồng khu vực khác nhau và kế hoạch đã bị rút lại. Trong những năm 1620, một lần nữa bị ảnh hưởng bởi mong muốn cải cách cuộc sống của Tây Ban Nha trở nên tốt đẹp hơn, Philip cũng đã thông qua luật pháp đáng kể với các âm bội. Năm 1623, ông đã đóng cửa tất cả các nhà thổ hợp pháp ở Tây Ban Nha, mở rộng luật lệ sum vầy không hoạt động đối với hàng hóa xa xỉ và hỗ trợ các nỗ lực của Giáo hoàng để điều chỉnh hành vi tình dục của các linh mục chặt chẽ hơn.[11]

Philip có ý định rõ ràng là cố gắng kiểm soát tiền tệ Tây Ban Nha, vốn ngày càng trở nên bất ổn trong triều đại của cha và ông, nhưng trên thực tế, lạm phát tăng vọt.[2] Một phần điều này là do vào năm 1627 Olivares đã cố gắng giải quyết vấn đề của các chủ ngân hàng Genova của Philip - người đã tỏ ra bất hợp tác trong những năm gần đây - bằng cách tuyên bố phá sản nhà nước.[12] Với khoản nợ Genova hiện đã được xóa, Olivares hy vọng sẽ chuyển sang các chủ ngân hàng bản địa để lấy lại tiền. Trong thực tế, kế hoạch là một thảm họa. Hạm đội kho báu Tây Ban Nha năm 1628 đã bị Hà Lan bắt giữ và khả năng vay và chuyển tiền của Tây Ban Nha trên khắp châu Âu giảm mạnh

Đến thập niên 1630, các chính sách đối nội của Philip ngày càng bị ảnh hưởng bởi áp lực tài chính của Chiến tranh Ba mươi năm, và đặc biệt là cuộc chiến ngày càng lớn với Pháp. Chi phí cho cuộc chiến là rất lớn, và trong khi chúng phần lớn rơi vào Castile, khả năng của vương miện để gây quỹ nhiều hơn và đàn ông từ nguồn này ngày càng bị hạn chế. Philip và chính phủ của ông đã cố gắng hết sức để giảm bớt trách nhiệm của chính quyền trung ương nhằm đối phó với sự căng thẳng của cuộc chiến, và những ý tưởng cải cách khác nhau có thể đã được theo đuổi trong những năm 1620 đã bị từ chối trên cơ sở này. Hạn chế tài chính và thuế cao hơn đã được đưa ra, nhưng Philip đang ngày càng bán đi các quyền phong kiến ​​và phong kiến, cùng với phần lớn tài sản của hoàng gia để tài trợ cho cuộc xung đột. Người ta đã lập luận rằng các quy tắc tài khóa của những năm 1630, kết hợp với sức mạnh và vai trò của Olivares và chính quyền, đã loại bỏ Philip khỏi ba trụ cột truyền thống hỗ trợ cho chế độ quân chủ: ông bà, Giáo hội và Hội đồng Castile.[13]

Khủng hoảng xảy ra vào năm 1640. Một nỗ lực của Olivares can thiệp vào Catalonia để đối phó với mối đe dọa xâm lược của Pháp đã dẫn đến cuộc nổi dậy. Một liên minh của phiến quân Catalan và các lực lượng hoàng gia Pháp tỏ ra thách thức đàn áp, và trong khi cố gắng huy động sự ủng hộ cao quý của Bồ Đào Nha cho cuộc chiến, Olivares đã kích hoạt một cuộc nổi dậy thứ hai. Giới quý tộc của Lisbon đã trục xuất Philip, và trao lại ngai vàng cho Braganzas, đánh dấu sự kết thúc sáu mươi năm của Liên minh Iberia và khởi đầu Chiến tranh Phục hồi Bồ Đào Nha. Năm sau, Công tước xứ Medina Sidonia đã cố gắng thực hiện một cuộc nổi loạn khác chống lại Philip từ Andalusia, có thể cố gắng tái tạo thành công của Braganzas ở Bồ Đào Nha. Mặc dù Philip và Olivares đã có thể đàn áp cuộc nổi dậy của công tước, Philip đã thấy mình ngày càng bị cô lập. Khi trở về từ Zaragoza, nơi ông đã chỉ huy quân đội, ông chỉ tìm thấy một trong những quý tộc Castilian đến tòa vào ngày lễ Phục sinh 1641. Mối đe dọa của Philip bị ông bà Castile phế truất dường như ngày càng có thật.[14]

Bị chấn động bởi các sự kiện, giải pháp của Philip là loại bỏ Olivares yêu thích của ông khỏi văn phòng năm 1643 trong nỗ lực thỏa hiệp với giới thượng lưu Tây Ban Nha. Ông tuyên bố sẽ cai trị một mình, bác bỏ cả khái niệm về sự yêu thích của hoàng gia với tư cách là bộ trưởng đầu tiên và hệ thống của chính phủ junta, mà ông bắt đầu dỡ bỏ để ủng hộ hệ thống các hội đồng hoàng gia cũ. Sự khoan hồng đã được thể hiện cho Công tước xứ Medina Sidonia. Tình hình bắt đầu ổn định, và không lâu sau Philip cảm thấy đủ an toàn để trở lại phương pháp chính phủ ưa thích của mình. Luis de Haro, cháu trai của Olivares, đảm nhận chức vụ yêu thích và bộ trưởng và cuộc cải cách của chính quyền đã dừng lại. Tuy nhiên, tia sáng của cải cách từ những năm trước của Philip không bao giờ quay trở lại. Cuộc nổi dậy ở Catalan kéo dài trong vài năm. Năm 1652, quân đội Tây Ban Nha chiếm lại Barcelona và Philip đã ban hành ân xá cho phiến quân, hứa sẽ tôn trọng các phong tục và quyền truyền thống trong tương lai.[15]